Ich konnte noch zusehen, wie backintime stündlich Backups erstellt. Aber das Tool manuell starten, um dort Einstellungen zu verändern oder auch auf Backups zuzugreifen funktionierte nicht mehr.Hierbei handelt es sich offensichtlich um einen bug, den man auch bei ubuntuusers.de mit Lösung nachlesen kann.
Lösung:
gedit ~/.config/backintime/config
löschen der Zeile:
gnome.last_path=/...
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